Går det att exportera till en kommaseparerad lista?
Mitt förslag är då terminalen:
cat kommasepareradfil.csv | while read line; do mv -vi "${line%%,*}" "${line##*,}"; done
Detta är inte testat så se för allt i världen till att du har en backup innan!
Spara den kommaseparerade listan i samma katalog som filerna som ska döpas om och kör sedan kommandot därifrån.
Listan ska ha formatet "nuvarandefil,önskatfilnamn" (utan citationstecken)