Tjena!
Jag har stött på ett liknande problem, och det gäller bara en del utav mina bilder.
Om jag till exempel sitter och redigerar tre bilder, alla i raw-format för att sedan välja funktionen "spara som" och som jpeg, nio gånger av tio blir en utav dessa tre bilder korrupta och står då enligt photoshop som en jpeg precis som de andra två.
Om man däremot granskar bilderna lite närmare får man dock fram att bilden i sig som är korrupt är lika stor som orginalfilen i raw, medans de andra två ligger i min önskade storlek.
Jag brukar då få stänga ner den korrupta filen, slänga den, öppna upp den på nytt i Photoshop, göra om alla redigeringar och sedan spara ner den på nytt, då fungerar det. Det är väl ungefär samma problem som du verkar ha, dock inte i lika stor utsträckning.
Jag har ingen aning om varför det blir så, jag ska försöka återskapa problemet för att kunna ge en bättre förklaring, eventuellt hitta en lösning åt dig.
Mvh,
Jesper