Jag har inte märk av några problem, dock är det några som fått problem när de organiserat om sina bilder i undermappar och då blivit av med dom. Den buggen kan du läsa om på macosxhints.com.
Ett tips är att skapa en ny mapp högst upp i iphoto innan du uppgraderar ifall du har många bilder i den översta nu. Iphoto 5 skapar nämligen automatiskt en bok av bilderna i översta mappen. Har man då väldigt många bilder och inte en extremt snabb dator kan den boken bli väldigt tungjobbad.