Lägg till en "Ask for confirmation" action i början av ditt workflow. När du lägger något i mappen så drar "Folder-Action igång" men gör inget innan du tryck ok (vilket du enkelt "kringla + tab:ar", sedan "Enter" till när du väl är redo för att skriptet ska köra igång).
Vet dock inte om detta löser ditt problem. Jag använder det för att vänta in att X st bilder läggs i en ny mapp innan de flyttas över till server. Utan att vänta på "Confirmation" så lägger action:et över den nya mappen till servern, utan att vänta på att den fylls med bilder först.