Jag antar att du använder Indesign? Låter lite underligt att fonter skulle åstadkomma det där, och man tycker ju att tryckeriet skulle se upp bättre om rippen varnat för postscriptfel.
Är det verkligen tryckt (alltså rippat och utkört på film/plåt och rullat i en press)? Är det en liten upplaga så kan det ju ha gått i en skrivare "digitalpress" istället. Jag har nämligen sett såna där rutor med aningen avvikande färg där transparenseffekter är inblandade på vanliga kontorsskrivare som (tror jag) inte behandlar rasterbilder likadant som vektorbilder och oftast får du just en blandning av vektor och raster när genomskinligheten förenklas.
Vår förra Ricoh skrev ut med såna där rutor, vår nuvarande gör det inte. En väg runt det är att göra en egen förenklingsinställning som tvingar allt till raster, men det blir långsamt med tunga pdfer som resultat. En annan sak att kolla är att inga färghanteringsinställningar är påslagna i själva skrivaren.